Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Foxj1Q61660 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Foxj1Q61660 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxj1Q61660 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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