Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hif1aQ61221 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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