Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms