Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurod1Q60867 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms