Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Caprin1Q60865 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms