Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3Q60803 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms