Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf4Q60722 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms