Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sin3aQ60520 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms