Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam71bQ5STT6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms