Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Znrf3Q5SSZ7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Znrf3Q5SSZ7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Znrf3Q5SSZ7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Znrf3Q5SSZ7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Znrf3Q5SSZ7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Znrf3Q5SSZ7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Znrf3Q5SSZ7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Znrf3Q5SSZ7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Znrf3Q5SSZ7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znrf3Q5SSZ7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms