Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf215Q5SPX3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf215Q5SPX3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms