Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms