Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms