Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

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Length 820 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Scarf1Q5ND28 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Scarf1Q5ND28 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Scarf1Q5ND28 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Scarf1Q5ND28 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Scarf1Q5ND28 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Scarf1Q5ND28 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Scarf1Q5ND28 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Scarf1Q5ND28 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scarf1Q5ND28 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarf1Q5ND28 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarf1Q5ND28 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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