Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spata48Q5NC83 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms