Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3kQ5GIG6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3kQ5GIG6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms