Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkaa1Q5EG47 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkaa1Q5EG47 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms