Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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Nlrc3Q5DU56 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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