Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eme2Q56A04 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eme2Q56A04 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms