Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shank3Q4ACU6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shank3Q4ACU6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms