Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srbd1Q497V5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms