Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lin28bQ45KJ6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms