Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx25Q3ZT31 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Snx25Q3ZT31 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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