Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
E330034G19RikQ3UWX6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms