Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Znf48Q3US17 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Znf48Q3US17 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Znf48Q3US17 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Znf48Q3US17 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Znf48Q3US17 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Znf48Q3US17 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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