Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
D13Ertd608eQ3UPR8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms