Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgef40Q3UPH7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgef40Q3UPH7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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