Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc4Q3UP24 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc4Q3UP24 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms