Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cog7Q3UM29 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms