Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm648Q3UJ22 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Gm648Q3UJ22 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm648Q3UJ22 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm648Q3UJ22 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm648Q3UJ22 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm648Q3UJ22 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm648Q3UJ22 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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