Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms