Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.4 ms