Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc174Q3U155 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms