Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TraddQ3U0V2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms