Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms