Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Srsf6Q3TWW8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms