Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms