Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc102aQ3TMW1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms