Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarca4Q3TKT4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca4Q3TKT4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarca4Q3TKT4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms