Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms