Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms