Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
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Shroom4Q1W617 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shroom4Q1W617 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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Shroom4Q1W617 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
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