Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd3Q14AI6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rpusd3Q14AI6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd3Q14AI6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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