Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms