Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc39dQ0VF76 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc39dQ0VF76 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms