Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc45a4Q0P5V9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc45a4Q0P5V9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms