Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrioQ0KL02 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms