Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cass4Q08EC4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms