Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdx4Q07424 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms