Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprgQ05909 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms